上海生歸程兵營科院發現DNA堿基編輯的新方法

文章来源:文迪 时间:2018-12-26

  上海生歸程兵營科院發現DNA堿基編輯的新方法

  10月10日,國際學術期刊《自然-办法》(Nature Methods)在線發表瞭上海生命科學研讨院/上海交通大學醫學院安康科學研讨所常興研讨組題為Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic diversification in mammalian cells 的最新研讨结果,報道瞭使用靶向性胞嘧啶脫氨酶在體內實現高效率和高通量的DNA堿基編輯的新办法。

  單核苷酸的多樣性是遺傳多樣性的次要來源,是分子進化的動力和很多疾病的直接誘因 。但是由於哺乳動物基因組的高度穩定性,在哺乳動物細胞內很難高效和高通量地誘導單核苷酸的突變,進而研讨這些突變的功用 。雖然通過CRISPR等基因編輯技術,能够實現較高效的DNA切割和基因敲除,除瞭將觀摩票定向發放至休息榜樣、社區居民、醫護任務者、大中院校師生、地鐵公交司機、首都意願者等各界群眾手中,局部觀摩票將實行線上實名收費搶票,12月15日上午10點起,將在國度大劇院大眾效勞號票務管傢開啟搶票通道,搶完即止但由於同源重組(HDR)的效率低下,現有的CRISPR技術對於體內構建單核苷酸突變仍處於低效階段。

  靶向性AID介導的核苷酸突變(TAM)這種新的研讨办法,有能够改變這一現狀。有別於絕大多數體細胞基因組,適應性免疫系統在淋巴細胞發育過程中能够進行高效編輯,對抗原受體進行高效突變,產生近乎無限的抗原受體庫,用以抵禦能够的病原體入侵。受這一“突變自我”機制的啟發,博士研讨生馬雲青和張佳元在研讨員常興的指導下發現,當把核酸酶缺陷的Cas9蛋白和誘導抗體高頻突變的胞嘧啶脫氨酶AID交融後,在sgRNA靶向的基因組DNA上,胞嘧啶和鳥嘌呤能够隨機地向其它三個堿基轉變 。這一新办法能够對細胞內的特定DNA序列進行多樣化,完成遺傳篩選,從而剖析單核苷酸突變的功用 。同時在一種多肽抑制劑的輔助下,dCas9-AID能够誘導特定的胞嘧啶向胸腺嘧啶轉變,實現單堿基的精確編輯。該研讨團隊進一步證明,使用這一办法能够疾速无效地模擬腫瘤細胞體內耐藥機制的異質性,預測能够的腫瘤耐藥性突變,進而改进小分子抑制劑和研讨小分子與蛋白質靶點的互相作用。該研讨结果為分子進化、基因治療和在單堿基程度上剖析基因調控元件等領域提供新的办法  。

  該任务失掉瞭中組部青年千人計劃、科技部、國傢自然科學基金委和上海市科委的相關資助。

  

  

上海生科院發現DNA堿基編輯的新办法